サクラエディタで空行を削除する方法です。
手順
このようなファイルから空行を削除してみます。

①メニュー「検索」⇒「置換」を選択する

ショートカット[Ctrl]+[R]でもOKです。
②置換画面で、置換前に「^[\r\n]+」、正規表現にチェックを入れて「すべて置換」ボタンをクリックする

上の例はWindowsで作成したテキストファイルを対象とした例です。
MacやUnix系で作成したテキストファイルの場合は改行コードが異なりますので、
改行コードの部分(¥r¥nの箇所)を以下のように置き換えてください。
| Windowsで作成したテキストファイル | \r\n |
|---|---|
| Mac/Unix/Linxで作成したテキストファイル | \n |
| MacOS X以前のMacで作成したテキストファイル | \r |
③これで空行が削除されます。

備考
- 空行が削除される仕組みとしては、空行を表す正規表現「^[\r\n]+」をブランクで置換して空行を削除しています。

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